<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Immunology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Immunology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Российский иммунологический журнал</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1028-7221</issn><issn publication-format="electronic">2782-7291</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Russian Society of Immunology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">16962</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.46235/1028-7221-16962-PSO</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Primary screening of chemically modified immunosuppressive oligonucleotides using in vitro model with spleen lymphocytes</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Первичный скрининг химически модифицированных иммуносупрессорных олигонуклеотидов на лимфоцитах селезенки в модели in vitro</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Gavrilova</surname><given-names>E. D.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Гаврилова</surname><given-names>Елена Давидовна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Biology), Head оf Laboratory of Experimental Immunotherapy; Senior Researcher of the Laboratory of Immunology of nucleic acids.</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.б.н., заведующий лабораторией экспериментальной иммунотерапии; старший научный сотрудник лаборатории иммунологии нуклеиновых кислот.</p></bio><email>edav.gavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Goiman</surname><given-names>E. V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Гойман</surname><given-names>Елена Владимировна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Medicine), Research Associate, Laboratory of Experimental Immunotherapy, Engineer, Laboratory of Immunology of Nucleic Acids</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.м.н., научный сотрудник лаборатории экспериментальной иммунотерапии, инженер лаборатории иммунологии нуклеиновых кислот</p></bio><email>edav.gavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Derzalova</surname><given-names>A. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Держалова</surname><given-names>Алина Шарафидиновна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Junior Research Associate, Laboratory of Immunology of Nucleic Acids</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>младший научный сотрудник лаборатории иммунологии нуклеиновых кислот</p></bio><email>edav.gavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Stetsenko</surname><given-names>D. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Стеценко</surname><given-names>Дмитрий Александрович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Chemistry), Head, Laboratory of Chemistry of Nucleic Acids, Head, Russo-Franco-Japanese Laboratory of Bionanotechnology, Faculty of Physics</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.х.н., заведующий лабораторией химии нуклеиновых кислот, заведующий Российско-франко-японской лабораторией бионанотехнологии</p></bio><email>edav.gavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Burakova</surname><given-names>E. A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Буракова</surname><given-names>Екатерина Анатольевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Chemistry), Head, Laboratory of Immunology of Nucleic Acids, Research Associate, Russo-Franco-Japanese Laboratory of Bionanotechnology, Faculty of Physics</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.х.н., заведующая лабораторией иммунологии нуклеиновых кислот, научный сотрудник Российско-франко-японской лаборатории бионанотехнологии</p></bio><email>edav.gavr@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/><xref ref-type="aff" rid="aff3"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch, Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр “Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук”»</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Research Institute of Fundamental and Clinical Immunology</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГБНУ «Научно-исследовательский институт фундаментальной и клинической иммунологии»</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff3"><aff><institution xml:lang="en">Novosibirsk State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">ФГАОУ ВО «Новосибирский национальный исследовательский государственный университет»</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2024-12-22" publication-format="electronic"><day>22</day><month>12</month><year>2024</year></pub-date><volume>28</volume><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>25</fpage><lpage>32</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-05-16"><day>16</day><month>05</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2024-07-31"><day>31</day><month>07</month><year>2024</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2024, Gavrilova E.D., Goiman E.V., Derzalova A.S., Stetsenko D.A., Burakova E.A.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2024, Гаврилова Е.Д., Гойман Е.В., Держалова А.Ш., Стеценко Д.А., Буракова Е.А.</copyright-statement><copyright-year>2024</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Gavrilova E.D., Goiman E.V., Derzalova A.S., Stetsenko D.A., Burakova E.A.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Гаврилова Е.Д., Гойман Е.В., Держалова А.Ш., Стеценко Д.А., Буракова Е.А.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://rusimmun.ru/jour/article/view/16962">https://rusimmun.ru/jour/article/view/16962</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Control of immune response following transplantation of cells, tissues, or organs includes reduction negative effects caused by acute graft-versus-host disease (GVHD) developing during bone marrow transplantation, thus being an urgent task of modern clinical practice. In this view, the management of immunological tolerance is a promising approach, in particular, the ability of immune cells (especially, dendritic cells) to induce this response using experimental models of allogeneic transplant rejection, GVHD and autoimmune disorders. Therefore, the search for compounds that can effectively activate or suppress immune cells and regulate immunological tolerance is of importance. The purpose of this work was to study the effects of synthetic immunosuppressive oligodeoxynucleotides (INH-ODN) on <italic>in vitro</italic> splenocyte proliferation and IL-12 production, in order to select the most promising compounds for subsequent <italic>in vivo</italic> experiments. We have tested several immunosuppressive agents: thiophosphate oligodeoxynucleotides (A151, ODN2088 and ODN4084-F), which include G-rich regions, as well as their analogues, i.e., thiophosphate oligodeoxynucleotides with mesylphosphoramide (ì) modifications at GpG bonds (ì-A151, ì-ODN2088 and ì-ODN4084-F). The effects of chemically modified oligonucleotides were assessed in the <italic>in vitro</italic> model of CpG-stimulated splenocytes, using CpG-ODN SD-101 in its complete thiophosphate (PS) version. Primary <italic>in vitro</italic> screening of immunosuppressive oligonucleotides by their effect on splenocyte proliferation and IL-12 production enabled us to identify the most active compounds and determine the features of sequences with the most pronounced immunosuppressive properties, as well as establish optimal concentrations of the studied oligodeoxynucleotides selected for subsequent <italic>in vivo</italic> studies.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Контроль за иммунными реакциями, протекающими в организме при трансплантации клеток, тканей или органов, в том числе для снижения негативных последствий при острой форме болезни «трансплантат против хозяина» (РТПХ), развивающейся при пересадке костного мозга, является актуальной задачей на сегодняшний день в клинической практике. В этой связи перспективным направлением является управление иммунологической толерантностью и способность иммунных клеток, в частности дендритных, индуцировать ее в моделях отторжения аллогенного трансплантата, РТПХ и аутоиммунных расстройств. Вот почему важен поиск соединений, способных эффективно активировать или подавлять иммунные клетки и регулировать иммунологическую толерантность. Целью настоящей работы было изучение влияния синтетических иммуносупресорных олигодезоксинуклеотидов (INH-ODN) на пролиферацию спленоцитов и продукцию IL-12 <italic>in vitro</italic> для отбора наиболее перспективных для дальнейших экспериментов <italic>in vivo</italic>. Для исследования были синтезированы иммуносупрессорные тиофосфатные олигодезоксинуклеотиды (А151, ODN2088 и ODN4084-F), которые включают G-богатые участки, а также их аналоги – тиофосфатные олигодезоксинуклеотиды с мезилфосфорамидными (ì) модификациями по GpG связям (ì-А151, ì-ODN2088 и ì-ODN4084-F). Эффекты химически модифицированных олигонуклеотидов оценивали на модели СpG-стимулированных спленоцитов <italic>in vitro</italic>. Первичный скрининг иммуносупрессорных олигонуклеотидов в культуре <italic>in vitro</italic> по их влиянию на пролиферацию спленоцитов и продукцию IL-12 позволил выделить несколько наиболее активных соединений и определить характер последовательности с наиболее выраженными иммунодепрессивными свойствами.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>immune tolerance</kwd><kwd>graft-versus-host disease</kwd><kwd>autoimmune disorders</kwd><kwd>TLR9 antagonists</kwd><kwd>immunosuppressive oligonucleotides</kwd><kwd>regulatory T cells</kwd><kwd>DNA analogues</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>иммунологическая толерантность</kwd><kwd>реакция «трансплантат против хозяина»</kwd><kwd>аутоиммунные заболевания</kwd><kwd>антагонисты TLR9</kwd><kwd>иммуносупрессорные олигонуклеотиды</kwd><kwd>регуляторные Т-клетки</kwd><kwd>аналоги ДНК</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Российский Научный Фонд</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Russian Science Foundation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>23-23-00487</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Головинская О.В., Байкова М.Л., Алпатова Н.А., Зубков Д.А., Фоменко В.В., Гайдерова Л.А. Сравнительный анализ красителей, используемых при оценке специфической активности лекарственных средств на основе филграстима биологическим методом in vitro // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение, 2020. Т. 20, № 3. С. 193-201. [Golovinskaya O.V., Baykova M.L., Alpatova N.A., Zubkov D.A., Fomenko V.V., Gaiderova L.A. Comparative analysis of dyes used in assessing the specific activity of filgrastim-based drugs using a biological method in vitro. BIOpreparaty. Profilaktika, diagnostika, lechenie = Biopreparations. Prevention, Diagnosis, Treatment, 2020, Vol. 20, no. 3, pp. 193-201. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Останин А.А., Леплина О.Ю., Буракова Е.А., Тыринова Т.В., Фокина А.А., Проскурина А.С., Богачев С.С., Стеценко Д.А., Черных Е.Р. CpG олигонуклеотиды с модифицированными фосфатными группами индуцируют созревание миелоидных дендритных клеток человека in vitro // Вавиловский журнал генетики и селекции, 2020. Т.24, № 6. С. 653-660. [Ostanin A.A., Leplina O.Y., Burakova E.A., Tyrinova T.V., Fokina A.A., Proskurina A.S., Bogachev S.S., Stetsenko D.A., Chernykh E.R. Phosphate-modified CpG oligonucleotides induce in vitro maturation of human myeloid dendritic cells. Vavilovskiy zhurnal genetiki i selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2020, Vol. 24, no 6, pp. 653-660. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Anderson B.A., Freestone G.C., Low A., De-Hoyos C.L., III W.J.D., Østergaard M.E., Migawa M.T., Fazio, M., Wan, W.B., Berdeja, A., Scandalis E., Burel S.A., Vickers T.A., Crooke S.T., Swayze E.E., Liang X., Seth P.P. Towards next generation antisense oligonucleotides: mesylphosphoramidate modification improves therapeutic index and duration of effect of gapmer antisense oligonucleotides. Nucleic Acids Res., 2021, Vol. 49, no. 16, pp. 9026–9041.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Audiger C., Rahman M.J., Yun T.J., Tarbell K.V., Lesage S. The importance of dendritic cells in maintaining immune tolerance. J. Immunol., 2017, Vol. 198, pp. 2223-2231.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Bayik D., Gursel I., Klinman D.M. Structure, mechanism and therapeutic utility of immunosuppressive oligonucleotides. Pharmacol. Res., 2016, Vol. 105, pp. 216-225.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Gratwohl A., Baldomero H. Trends of hematopoietic stem cell transplantation in the third millennium. Curr. Opin. Hematol., 2009, Vol. 16, no. 6, pp. 420-426.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Haniffa M., Collin M., Ginhoux F. Ontogeny and functional specialization of dendritic cells in human and mouse. Adv. Immunol., 2013, Vol. 120, pp. 1-49.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Lutz M.B. Induction of CD4(+) regulatory and polarized effector/helper T cells by dendritic cells. Immune Netw., 2016, no. 16, pp. 13-25.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Maldonado R.A., von Andrian U.H. How tolerogenic dendritic cells induce regulatory T cells. Adv. Immunol., 2010, Vol. 108, pp. 111-165.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Miroshnichenko S.K., Patutina O.A., Burakova E.A., Chelobanov B.P., Fokina A.A., Vlassov V.V., Altman S., Zenkova M.A., Stetsenko D.A. Mesyl phosphoramidate antisense oligonucleotides as an alternative to phosphorothioates with improved biochemical and biological properties. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2019, Vol. 116, no. 4, рр. 1229-1234.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Patutina O.A., Gaponova (Miroshnichenko) S.K., Senkova A.V., Savin I.A., Gladkikh D.V., Burakova E.A., Fokina A.A., Maslov M.A., Shmendel E.V., Wood M.J.A., Vlassov V.V., Altman S., Stetsenko D.A., Zenkova M.A. Mesyl phosphoramidate backbone modified antisense oligonucleotides targeting miR-21 with enhanced in vivo therapeutic potency. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2020, Vol. 117, no. 51, рр. 32370-32379.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Qian C., Cao X. Dendritic cells in the regulation of immunity and inflammation. Semin. Immunol., 2018, Vol. 35, no. 2, pp. 3-11.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Raker V.K., Domogalla M.P., Steinbrink K. Tolerogenic dendritic cells for regulatory T cell induction in man. Front. Immunol., 2015, Vol. 6, 569. doi: 10.3389/fimmu.2015.00569.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Socié G., Blazar B.R. Acute graft-versus-host disease: from the bench to the bedside. Blood, 2009, Vol. 114, no. 20, pp. 4327-4336.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Su Y., Fujii H., Burakova E.A., Chelobanov B.P., Fujii M., Stetsenko D.A., Filichev V.V. Neutral and negatively charged phosphate modifications altering thermal stability, kinetics of formation and monovalent ion dependence of DNA G-Quadruplexes. Chem. Asian J., 2019, Vol. 14, no. 8, pp. 1212-1220.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
