<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Immunology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Immunology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Российский иммунологический журнал</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1028-7221</issn><issn publication-format="electronic">2782-7291</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Russian Society of Immunology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17127</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.46235/1028-7221-17127-NAT</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Novel approach to cell cycle analysis of T lymphocytes using flow cytometry</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Новый подход к анализу клеточного цикла Т-лимфоцитов методом проточной цитометрии</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-4342-5362</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">8927-1127</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Saidakova</surname><given-names>Evgeniya V.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Сайдакова</surname><given-names>Евгения Владимировна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD, MD (Biology), Associate Professor, Head, Laboratory of Molecular Immunology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.б.н., доцент, заведующая лабораторией молекулярной иммунологии</p></bio><email>radimira@list.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Ecology and Genetics of Microorganisms, Perm Federal Research Center, Ural Branch, Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук – филиал ФГБУН «Пермский федеральный исследовательский центр» Уральского отделения Российской академии наук</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-06-03" publication-format="electronic"><day>03</day><month>06</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-09-18" publication-format="electronic"><day>18</day><month>09</month><year>2025</year></pub-date><volume>28</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>363</fpage><lpage>368</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-03-19"><day>19</day><month>03</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-05-25"><day>25</day><month>05</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Saidakova E.V.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Сайдакова Е.В.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Saidakova E.V.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Сайдакова Е.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://rusimmun.ru/jour/article/view/17127">https://rusimmun.ru/jour/article/view/17127</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Intensive proliferation of T lymphocytes is essential for the development of both natural and vaccine-induced immunity. As a result, impaired T cell proliferation could influence disease susceptibility and vaccination effectiveness. A methodology enabling definition of dividing cells fraction, proliferation rate, as well as the cell cycle phases, would substantially enhance our understanding of the causes and mechanisms inderlying impaired T lymphocyte division. The aim of our study was to validate a novel approach for analyzing cell cycle of T lymphocytes at different maturation stages via flow cytometry. The study was performed with peripheral blood samples collected from healthy individuals. Peripheral blood mononuclear cells were isolated by density-gradient centrifugation, stimulated with phytohemagglutinin, and cultivated for 4 days under standard conditions (37 °C, 5% CO2). Activated leukocytes were labeled with the LIVE/DEAD Fixable Violet Dead Cell Stain and antibodies specific for CD3 BV605, CD4 PE, CD8 BV510, CCR7 PE/Cy7, and CD45RO APC-eF780. The fixed and permeabilized cells were further stained with antibodies targeting pRb AF488 and pHH3 AF647, along with the DAPI nuclear stain. Flow cytometric analysis was conducted using a CytoFLEX S instrument. The proposed technique allowed successful distinction between T lymphocytes in G0, G1, S, G2, and M phases of the cell cycle. Moreover, the designed fluorescence panel permits concurrent detection of CD4+ and CD8+T cells at diverse maturation states. During the pilot study, we have quantified the numbers of CD4+ and CD8+T lymphocytes progressing into active cell cycle phases, along with their phase-specific distributions. The differences in proliferation dynamics were also observed for naive CD4+ and CD8+T lymphocytes, central memory, effector memory, and terminal effector subsets. The proposed method enables comprehensive evaluation of the cell cycle progression in CD4+ and CD8+T lymphocytes across distinct maturation stages by means of flow cytometry.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>Способность Т-лимфоцитов к интенсивной пролиферации является основой формирования как естественного, так и поствакцинального иммунитета. Соответственно, нарушение деления Т-клеток может отражаться на восприимчивости человека к заболеваниям и эффективности вакцинации. Подход, который позволит определять не только долю делящихся клеток и активность пролиферации, но и фазы клеточного цикла, значительно расширит возможности исследования причин и механизмов нарушения деления Т-лимфоцитов. Цель – апробировать новый подход к анализу клеточного цикла Т-лимфоцитов разной степени зрелости с использованием проточной цитометрии. Объектом исследования служила периферическая кровь, полученная от здоровых доноров. Мононуклеарные клетки периферической крови выделяли центрифугированием в градиенте плотности диаколла стандартным методом и стимулировали фитогемагглютинином, после чего культивировали в течение 4 суток (37 °С, 5% CO2). Активированные лейкоциты окрашивали витальным красителем LIVE/DEAD Fixable Violet Dead Cell Stain и антителами CD3 BV605, CD4 PE, CD8 BV510, CCR7 PE/Cy7 и CD45RO APC-eF780. Клетки фиксировали и пермеабилизировали, после чего окрашивали антителами к pRb AF488 и pHH3 AF647, а также красителем DAPI. Анализ клеток проводили на проточном цитометре CytoFLEX S. Установлено, что предложенный подход позволяет различать Т-лимфоциты, находящиеся в G0, G1, S, G2 и M-фазах клеточного цикла. Более того, разработанная панель флуоресцентных красителей и антител позволяет одновременно идентифицировать CD4+ и CD8+Т-клетки различной степени зрелости. Так, в пилотном исследовании было установлено количество CD4+ и CD8+Т-лимфоцитов, вступивших в активные фазы клеточного цикла, и особенности их распределения по фазам. Также были выявлены отличия паттернов пролиферации наивных CD4+ и CD8+Т-лимфоцитов, соответствующих клеток центральной и эффекторной памяти, а также терминальных эффекторов. Предложенный метод позволяет проводить комплексный анализ клеточного цикла CD4+ и CD8+Т-лимфоцитов разной степени зрелости с использованием проточной цитометрии.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>CD4+T lymphocytes</kwd><kwd>CD8+T lymphocytes</kwd><kwd>naive cells</kwd><kwd>memory cells</kwd><kwd>cell cycle</kwd><kwd>flow cytometry</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>CD4+Т-лимфоциты</kwd><kwd>CD8+Т-лимфоциты</kwd><kwd>наивные клетки</kwd><kwd>клетки памяти</kwd><kwd>клеточный цикл</kwd><kwd>проточная цитометрия</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Правительство РФ</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Government of the Russian Federation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>124021900006-5</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Марченко Д.М., Сайдакова Е.В. Новые маркеры для исследования пролиферации Т-лимфоцитов человека // Вестник Пермского университета. Серия «Биология», 2021. № 4, С. 316-323. [Marchenko D.M., Saidakova E.V. Novel human T-cell proliferation markers. Vestnik Permskogo universiteta. Seriya “Biologiya” = Bulletin of Perm University. Biology, 2021, no. 4, pp. 316-323. (In Russ.)]</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Banks H.T., Sutton K.L., Thompson W.C., Bocharov G., Roose D., Schenkel T., Meyerhans A. Estimation of cell proliferation dynamics using CFSE data. Bull. Math. Biol., 2011, Vol. 73, no. 1, pp. 116-150.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Cooper S., Shayman J.A. Revisiting retinoblastoma protein phosphorylation during the mammalian cell cycle. Cell. Mol. Life Sci., 2001, Vol. 58, no. 4, pp. 580-595.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Crosio C., Fimia G.M., Loury R., Kimura M., Okano Y., Zhou H., Sen S., Allis C.D., Sassone-Corsi P. Mitotic phosphorylation of histone H3: spatio-temporal regulation by mammalian Aurora kinases. Mol. Cell. Biol., 2002, Vol. 22, no. 3, pp. 874-885.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Darzynkiewicz Z. Critical aspects in analysis of cellular DNA content. Curr. Protoc. Cytom., 2011, Chapter 7, pp. 721-728.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Kalimuddin S., Tham C.Y.L., Chan Y.F.Z., Hang S.K., Kunasegaran K., Chia A., Chan C.Y.Y., Ng D.H.L., Sim J.X.Y., Tan H.-C., Syenina A., Ngoh A.Q., Hamis N.Z., Chew V., Leong Y.S., Yee J.X., Low J.G., Chan K.R., Ong E.Z., Bertoletti A., Ooi E.E. Vaccine-induced T cell responses control Orthoflavivirus challenge infection without neutralizing antibodies in humans. Nat. Microbiol., 2025, Vol. 10, no. 2, pp. 374-387.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Kim C., Fang F., Weyand C.M., Goronzy J.J. The life cycle of a T cell after vaccination – where does immune ageing strike? Clin. Exp. Immunol., 2017, Vol. 187, no. 1, pp. 71-81.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Motamedi M., Xu L., Elahi S. Correlation of transferrin receptor (CD71) with Ki67 expression on stimulated human and mouse T cells: The kinetics of expression of T cell activation markers. J. Immunol. Methods, 2016, Vol. 437, pp. 43-52.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Rothaeusler K., Baumgarth N. Assessment of cell proliferation by 5-bromodeoxyuridine (BrdU) labeling for multicolor flow cytometry. Curr. Protoc. Cytom., 2007, Chapter 7, Unit 7.31. .</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Schmid I., Ferbas J., Uittenbogaart C.H., Giorgi J.V. Flow cytometric analysis of live cell proliferation and phenotype in populations with low viability. Cytometry, 1999, Vol. 35, no. 1, pp. 64-74.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Wang L., Nicols A., Turtle L., Richter A., Duncan C.J., Dunachie S.J., Klenerman P., Payne R.P. T cell immune memory after covid-19 and vaccination. BMJ Med., 2023, Vol. 2, no. 1, e000468. doi: 10.1136/bmjmed-2022-000468.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
