<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="brief-report" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Immunology</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Immunology</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Российский иммунологический журнал</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">1028-7221</issn><issn publication-format="electronic">2782-7291</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Russian Society of Immunology</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">17212</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.46235/1028-7221-17212-EOC</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>SHORT COMMUNICATIONS</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>КРАТКИЕ СООБЩЕНИЯ</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Short Communication</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Evaluation of changed metabolite profiles in SIM-A9 microglial cells under the influence of hypoxia and lipopolysaccharide</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Оценка изменений профилей метаболитов в клетках микроглии SIM-A9 под действием гипоксии и липополисахарида</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bobrov</surname><given-names>Mikhail Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бобров</surname><given-names>Михаил Юрьевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>PhD (Сhemistry), Leading Researcher in the Field of “Immunobiology and biomedicine”, Scientific Center of Genetics and Life Sciences</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>к.х.н., ведущий научный сотрудник направления «Иммунобиология и биомедицина» Научного центра генетики и наук о жизни</p></bio><email>bobrov.my@talantiuspeh.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikitin</surname><given-names>V. S.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Никитин</surname><given-names>В. С.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Laboratory Research Assistant, Master’s Student (Immunobiology and Biomedicine)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>лаборант-исследователь, студент магистратуры (направление «Иммунобиология и биомедицина»)</p></bio><email>bobrov.my@talantiuspeh.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Burak</surname><given-names>M. Yu.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Бурак</surname><given-names>М. Ю.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Laboratory Research Assistant, Master’s Student (Immunobiology and Biomedicine)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>лаборант-исследователь, студент магистратуры (направление «Иммунобиология и биомедицина»)</p></bio><email>bobrov.my@talantiuspeh.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Afonin</surname><given-names>M. B.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Афонин</surname><given-names>М. Б.</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Chief Research Engineer, Resource Center for Analytical Methods</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>главный инженер-исследователь ресурсного центра аналитических методов</p></bio><email>bobrov.my@talantiuspeh.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Sirius University of Science and Technologies</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">АНОО ВО «Научно-технологический университет “Сириус”»</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-05-26" publication-format="electronic"><day>26</day><month>05</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2025-09-18" publication-format="electronic"><day>18</day><month>09</month><year>2025</year></pub-date><volume>28</volume><issue>3</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>553</fpage><lpage>560</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2025-03-31"><day>31</day><month>03</month><year>2025</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-05-25"><day>25</day><month>05</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2025, Bobrov M.Y., Nikitin V.S., Burak M.Y., Afonin M.B.</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2025, Бобров М.Ю., Никитин В.С., Бурак М.Ю., Афонин М.Б.</copyright-statement><copyright-year>2025</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Bobrov M.Y., Nikitin V.S., Burak M.Y., Afonin M.B.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Бобров М.Ю., Никитин В.С., Бурак М.Ю., Афонин М.Б.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://rusimmun.ru/jour/article/view/17212">https://rusimmun.ru/jour/article/view/17212</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Microglial cells play a leading role in development of neuroinflammation. Activation of microglia leads to the formation of reactive phenotypes that can both contribute to the development of neuroinflammation and ensure its relief. Microglia activation is accompanied by metabolic reprogramming or changes in the metabolic pathways activity and the content of specific metabolites supporting a particular phenotype. An opportunity of phenotype switching due to metabolomic reprogramming may have real therapeutic potential. However, currently there are limited data on changes in composition of metabolites and activity of metabolic pathways in microglial cells under the influence of neuroinflammatory factors. In this regard, the purpose of this work was to conduct a non-targeted metabolomic study to assess changes of metabolites profiles in microglial cell line SIM-A9 exposed to hypoxia, as well as during TLR4 activation. Metabolite profiling of cell extracts exposed to hypoxia or lipopolysaccharide was performed using high-performance liquid chromatography and high-resolution mass spectrometry, followed by bioinformatics analysis of the data. The performed studies have shown that hypoxia, as well as TLR4 stimulation, lead to noticeable changes in the metabolism of microglial cells. At the same time, the nature of these changes depends on the type of stress exposure and its duration. Changed activity of glutathione and arginine metabolic pathways may serve as a marker of the polarization of microglial cells after hypoxic exposure. The activation of TLR4 by lipopolysaccharide leads to modulation of pathways associated with energy metabolism, as well as changes in the metabolic pathways of aromatic amino acids. One may suggest that the analytic approach used in this work will allow us to further investigate the dynamics of metabolic changes under the influence of proinflammatory factors of various origin and to gain detailed data on their role in metabolic reprogramming of microglial cells at various stages of neuroinflammation.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В развитии нейровоспаления ведущую роль играют клетки микроглии. Активация микроглии приводит к формированию реактивных фенотипов, которые могут как способствовать развитию нейровоспаления, так и обеспечивать его разрешение. При активации микроглии происходит метаболическое репрограммирование или изменение активности путей метаболизма и содержания метаболитов, поддерживающих тот или иной фенотип. Возможность фенотипического переключения за счет метаболомного репрограммирования может иметь несомненный терапевтический потенциал, однако в настоящее время имеются ограниченные данные об изменении состава метаболитов и активности метаболических путей в клетках микроглии под действием нейровоспалительных факторов. В этой связи целью данной работы явилось проведение нетаргетного метаболомного исследования для оценки изменений профилей метаболитов в клетках линии микроглии SIM-A9 подвергнутых гипоксии, а также при активации TLR4. Профилирование метаболитов в экстрактах клеток, подвергнутых действию гипоксии или липополисахарида проводили с использованием высокоэффективной жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии высокого разрешения, с последующим биоинформатическим анализом данных. Результаты проведенных исследований свидетельствуют о том, что гипоксическое воздействие, а также стимуляция TLR4 приводят к заметным перестройкам метаболизма клеток микроглии. При этом характер данных перестроек зависит от типа стрессорного воздействия и его длительности. Изменение активности путей метаболизма глутатиона и аргинина может служить маркером поляризации клеток микроглии после гипоксического воздействия. Активация TLR4 под действием липополисахарида приводит к модулированию путей, ассоциированных с энергетическим обменом, а также изменению путей метаболизма ароматических аминокислот. Можно заключить, что использованный в данной работе подход позволит в дальнейшем исследовать динамику метаболических изменений под действием провоспалительных факторов различной природы и детализировать их роль в метаболическом репрограммирования клеток микроглии на различных этапах развития нейровоспаления.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>neuroinflammation</kwd><kwd>hypoxia</kwd><kwd>microglia</kwd><kwd>metabolomics</kwd><kwd>metabolite profiling</kwd><kwd>mass spectrometry</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>нейровоспаление</kwd><kwd>гипоксия</kwd><kwd>микроглия</kwd><kwd>метаболомика</kwd><kwd>профилирование метаболитов</kwd><kwd>масс-спектрометрия</kwd></kwd-group><funding-group><award-group><funding-source><institution-wrap><institution xml:lang="ru">Российский научный фонд</institution></institution-wrap><institution-wrap><institution xml:lang="en">Russian Science Foundation</institution></institution-wrap></funding-source><award-id>24-25-20146</award-id></award-group></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Chen B., Di B. Endogenous Ligands of TLR4 in microglia: potential targets for related neurological diseases. Curr. Drug Targets, 2024, Vol. 25, no. 14, pp. 953-970.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Fan H., Bai Q., Yang Y., Shi X., Du G., Yan J., Shi J., Wang D. The key roles of reactive oxygen species in microglial inflammatory activation: Regulation by endogenous antioxidant system and exogenous sulfur-containing compounds. Eur. J. Pharmacol., 2023, Vol. 956, 175966. doi: 10.1016/j.ejphar.2023.175966.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Hestad K., Alexander J., Rootwelt H., Aaseth J.O. The role of tryptophan dysmetabolism and quinolinic acid in depressive and neurodegenerative diseases. Biomolecules, 2022, Vol. 12, no. 7, 998. doi: 10.3390/biom12070998.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Iskusnykh I.Y., Zakharova A.A., Pathak D. Glutathione in brain disorders and aging. Molecules, 2022, Vol. 27, no. 1, 324. doi: 10.3390/molecules27010324.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Li S., Park Y., Duraisingham S., Strobel F.H., Khan N., Soltow Q.A., Jones D.P., Pulendran B. Predicting network activity from high throughput metabolomics. PLoS Comput. Biol., 2013, Vol 9, no. 7, e1003123. doi: 10.1371/journal.pcbi.1003123.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Liu Y., Wu L., Peng W., Mao X. Glial polarization in neurological diseases: Molecular mechanisms and therapeutic opportunities. Ageing Res. Rev., 2025, Vol. 104, 102638. doi: 10.1016/j.arr.2024.102638.</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Nair S., Sobotka K.S., Joshi P., Gressens P., Fleiss B., Thornton C., Mallard C., Hagberg H. Lipopolysaccharide-induced alteration of mitochondrial morphology induces a metabolic shift in microglia modulating the inflammatory response in vitro and in vivo. Glia, 2019, Vol. 67, no. 6, pp. 1047-1061.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Ock J., Jeong J., Choi W.S., Lee W.H., Kim S.H., Kim I.K., Suk K. Regulation of Toll-like receptor 4 expression and its signaling by hypoxia in cultured microglia. J. Neurosci. Res., 2007, Vol. 85, pp. 1989-1995.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Rana A.K., Bhatt B., Gusain C., Biswal S.N., Das D., Kumar M. Neuroimmunometabolism: how metabolism orchestrates immune response in healthy and diseased brain. Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., 2025, Vol. 328, no. 2, pp. E217-E229.</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Tyrtyshnaia A, Konovalova S, Bondar A, Ermolenko E, Sultanov R, Manzhulo I. Anti-inflammatory activity of N-Docosahexaenoylethanolamine and N-eicosapentaenoylethanolamine in a mouse model of lipopolysaccharide – induced neuroinflammation. Int. J. Mol. Sci., 2021, Vol. 22, no. 19, 10728. doi: 10.3390/ijms221910728.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Wang Y., Leak R.K., Cao G. Microglia-mediated neuroinflammation and neuroplasticity after stroke. Front. Cell. Neurosci., 2022, Vol. 16, 980722. doi: 10.3389/fncel.2022.980722.</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Wang Z., Zhu H., Xiong W. Advances in mass spectrometry-based multi-scale metabolomic methodologies and their applications in biological and clinical investigations. Sci. Bull. (Beijing), 2023, Vol. 68, no. 19, pp. 2268-2284.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Yang S., Qin C., Hu Z.W., Zhou L.Q., Yu H.H., Chen M., Bosco D.B., Wang W., Wu L.J., Tian D.S. Microglia reprogram metabolic profiles for phenotype and function changes in central nervous system. Neurobiol. Dis., 2021, Vol. 152, 105290. doi: 10.1016/j.nbd.2021.105290.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Yao L., Kan E.M., Lu J., Hao A., Dheen S.T., Kaur C., Ling E.A. Toll-like receptor 4 mediates microglial activation and production of inflammatory mediators in neonatal rat brain following hypoxia: role of TLR4 in hypoxic microglia. J. Neuroinflammation, 2013, Vol. 10, 23. doi: 10.1186/1742-2094-10-23.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
