Russian Journal of ImmunologyRussian Journal of ImmunologyRussian Journal of Immunology1028-72212782-7291Russian Society of Immunology57710.46235/1028-7221-346-AROSHORT COMMUNICATIONSКРАТКИЕ СООБЩЕНИЯA role of single nucleotide polymorphism in TNF, NOS3 and MMP9 genes at the risk of developing neonatal pneumoniaРоль полиморфных маркеров в генах TNF, NOS3 и MMP9 в риске развития неонатальных пневмонийMeremianinaE. A.МеремьянинаЕ. А.
Russian Federation

Meremianina Ekaterina A. - PhD (Medicine), Junior Research Associate, Laboratory of Molecular Immunology; Senior Lecturer, Department of Virology

105064, Moscow, Maly Kazenny lane, 5a

Phone: 7 (926) 184-14-89

Меремьянина Екатерина Андреевна - к.м.н., младший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии; старший преподаватель кафедры вирусологии

105064, Москва, Малый Казенный пер., 5а

Teл.: 8 (926) 184-14-89

ekatterine@gmail.comSvitichO. A.СвитичО. А.
Russian Federation

PhD, MD (Medicine), Corresponding Member, Russian Academy of Sciences, Professor, Department of Microbiology, Virology and Immunology; Director

Moscow

д.м.н., член-корреспондент РАН, профессор кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии; директор

Москва

AlievaA. I.АлиеваА. И.
Russian Federation

PhD, MD (Medicine), Associate Professor, Dean, Faculty of Medicine and Prevention

Makhachkala, Republic of Dagestan

д.м.н., доцент, декан медикопрофилактического факультета

г. Махачкала, Республика Дагестан

SobolevV. V.СоболевВ. В.
Russian Federation

PhD (Biology), Senior Research Associate, Laboratory of Molecular Immunology

Moscow

к.б.н., старший научный сотрудник лаборатории молекулярной иммунологии

Москва

I. Mechnikov Research Institute for Vaccines and SeraФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток имени И.И. Мечникова»Russian Medical Academy of Continuing Professional EducationФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения РФFirst Moscow State I. Sechenov Medical University (Sechenov University)ФГАОУ ВО «Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова» Министерства здравоохранения РФ (Сеченовский университет)Dagestan State Medical AcademyФГБОУ ВО «Дагестанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения РФ150720202332572622110202021102020Copyright ©; 2020, Meremianina E.A., Svitich O.A., Alieva A.I., Sobolev V.V.Copyright ©; 2020, Меремьянина Е.А., Свитич О.А., Алиева А.И., Соболев В.В.2020Meremianina E.A., Svitich O.A., Alieva A.I., Sobolev V.V.Меремьянина Е.А., Свитич О.А., Алиева А.И., Соболев В.В.https://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://rusimmun.ru/jour/article/view/577

Neonatal pneumonia is one of the most common causes of infant mortality. Moreover, the diagnosis of this pathology represents a difficult task and requires to seek for additional solutions in clinical and laboratory practice. One of the current and promising ways to diagnose rerlies on search of predictive markers among the innate and adaptive immunity genes involved in disease pathogenesis. We used bioinformatics analysis to select genes playing essential role developing neonatal pneumonia. Next, cord blood samples collected from 234 newborns were examined by real-time polymerase chain reaction for nine polymorphic markers in the TNF, IL10, IL17A, IL17F, IL6, NOS3, and MMP9 genes. The results of statistical analysis showed that heterozygous genotypes in the MMP9 and TNF genes were associated with the risk of developing early neonatal pneumonia, and also the protective role of homozygotes AA in the MMP9 gene and GG in the TNF gene. A search for associations with a risk of intrauterine pneumonia revealed an unfavorable role for heterozygous genotypes in the NOS3 and MMP9 genes. Thus, due to difficulties in diagnosis or in case of developing neonatal pneumonia, it may be recommended to add genetic analysis for assessing polymorphic markers in the MMP9 (rs17576), TNF (rs1800629) and NOS3 (rs1549758) genes along with standard test assays.

Неонатальные пневмонии являются одной из самых распространенных причин детской смертности. Вместе с тем диагностика данной патологии представляет собой непростую задачу и требует поиска дополнительных решений в клиническо-лабораторной практике. Одним из современных и перспективных направлений в диагностике является поиск предиктивных маркеров в генах факторов врожденного и адаптивного иммунитета, которые задействованы в процессах развития патологии. Для подбора генов, имеющих весомое значение в развитии неонатальных пневмоний, мы использовали биоинформационный анализ. Далее методом полимеразной цепной реакции в реальном времени была исследована пуповинная кровь от 234 новорожденных на девять полиморфных маркеров в генах TNF, IL10, IL17A, IL17F, IL6, NOS3 и MMP9. Статистический анализ полученных результатов показал ассоциацию гетерозиготных генотипов в генах MMP9 и TNF с риском развития ранней неонатальной пневмонии, а также протективную роль гомозигот AA в гене MMP9 и GG в гене TNF. Поиск ассоциаций с риском развития внутриутробной пневмонии выявил неблагоприятную роль гетерозиготных генотипов в генах NOS3 и MMP9. Таким образом, при трудностях в диагностике и новорожденным, находящимся в группе риска по развитию неонатальной пневмонии, в дополнение к классическим методам исследования можно рекомендовать сделать генетический анализ на исследование полиморфных маркеров в генах MMP9 (rs17576), TNF (rs1800629) и NOS3 (rs1549758).

innate immunityadaptive immunityneonatal pneumoniacongenital pneumoniasingle nucleotide polymorphismbioinformatic analysispolymerase chain reactionврожденный иммунитетадаптивный иммунитетранняя неонатальная пневмониявнутриутробная пневмонияполиморфные маркерыбиоинформационный анализполимеразная цепная реакция1. Антонов А.Г., Арестова Н.Н., Байбарина Е.Н. Неонатология: национальное руководство / Под ред. Н.Н. Володина. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2009. 848 c. [Antonov A.G., Arestova N.N., Baybarina E.N. Neonatology: national guideline. Ed. by N.N. Volodin]. Мoscow: GOETAR-Media, 2009. 848 p.2. Журавлева Л.Н., Новикова В.И. Показатели врожденного иммунитета при пневмониях у новорожденных // Охрана материнства и детства, 2018. № 2 (32). С. 27-31. [Zhuravleva L.N., Novikova V.I. System of congenital immunity in pneumonia in newborns. Okhrana materinstva i detstva = Maternal and Child Health, 2018, no. 2 (32), pp. 27-31. (In Russ.)]3. Bellanti J.A., Zeligs B.J. Current concepts of immune interventions in children with respiratory diseases. Respiration, 1994, Vol. 61, no. 1, pp. 3-7.4. Fattakhov N., Smirnova L., Atochin D., Parshukova D., Skuratovskaia D., Painter Q., Zatolokin P., Semke A., Litvinova L., Ivanova S. Haplotype analysis of endothelial nitric oxide synthase (NOS3) genetic variants and metabolic syndrome in healthy subjects and schizophrenia patients. Int. J. Obes. (Lond), 2018, Vol. 42, no. 12, pp. 2036-2046.5. Feng B., Mao Z-R, Pang K., Zhang S-L., Li L. Association of tumor necrosis factor v -308G/A and interleukin-6 -174G/C gene polymorphism with pneumonia-induced sepsis. J. Crit. Care, 2015, Vol. 30, no. 5, pp. 920-923.6. GBD 2015 Mortality and Causes of Death Collaborators. Global, regional, and national life expectancy, allcause mortality, and cause-specific mortality for 249 causes of death, 1980-2015: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015. Lancet, 2016, Vol. 388, no. 10053, pp. 1459-1544.7. Jeoung J.W., Kim D.M., Oh S., Lee J-S., Park S.S., Kim J.Y. The relation between endothelial nitric oxide synthase polymorphisms and normal tension glaucoma. J. Glaucoma, 2017, Vol. 26, no. 11, pp. 1030-1035.8. Qidwai T., Khan F. Tumour necrosis factor gene polymorphism and disease prevalence. Scand. J. Immunol., 2011, Vol. 74, no. 6, pp. 522-547.9. Wu M.Y., Wu Y., Zhang Y., Liu C.Y., Deng C.Y., Peng L., Zhou L. Associations between matrix metalloproteinase gene polymorphisms and glaucoma susceptibility: a meta-analysis. BMC Ophthalmol., 2017, Vol. 17, no. 1, 48. doi: 10.1186/s12886-017-0442-2.10. Zhang Y., Cao Y., Xin L., Gao N., Liu B. Association between rs1800629 polymorphism in tumor necrosis factor-v gene and dilated cardiomyopathy susceptibility: Evidence from case-control studies. Medicine (Baltimore), 2018, Vol. 97, no. 50, e13386. doi: 10.1097/MD.0000000000013386.11. Zhao F., Fan Z., Huang X. Role of matrix metalloproteinase-9 gene polymorphisms in glaucoma: a hospitalbased study in chinese patients. J. Clin. Lab. Anal., 2020, Vol. 34, no. 3, e23105. doi: 10.1002/jcla.23105.12. Zhou H., Zhu X. Association between matrix-metalloproteinase polymorphisms and prostate cancer risk: a meta-analysis and systematic review. Cancer Manag. Res., 2018, Vol. 10, pp. 5247-5259.