Расширенные гаплотипы на основе редких однонуклеотидных полиморфизмов TNFA и HLA DRB1 в ассоциации с ревматоидным артритом

Обложка


Цитировать

Полный текст

Аннотация

Ревматоидный артрит (РА) является мультифакторным сложно-наследуемым заболеванием, в основе генетического компонента которого лежат межгенные взаимодействия, приводящие к формированию генных сетей, и актуальным направлением изучения полигенной природы РА является оценка взаимодействий «ген – ген».
Среди возможных генетических факторов, способствующих развитию заболевания, основополагающая роль принадлежит генам главного комплекса гистосовместимости, а именно HLA II класса.К другой группе рассматриваемых в литературе генетических факторов восприимчивости или устойчивости к РА относят полиморфные варианты генов цитокинов. Одним из возможных генов кандидатов, обеспечивающих восприимчивость к данной патологии и вклад в иммунопатогенез, по литературным данным, является ген TNFA. Особое расположение данного гена позволяет предположить формирование расширенных гаплотипов TNFA HLA.
Исходя из вышеизложенного данной работе был проведен анализ особенностей распределения двухлокусных гаплотипов SNPs TNFA HLA DRB1 в ассоциации с ревматоидным артритом в популяции русских Челябинской области.
В исследовании использовались следующие методы: выделение образцов ДНК из цельной крови, проведение генотипирования исследуемых полиморфизмов генов с помощью ПЦР, ПДРФ с электрофоретической детекцией. Расчет частот двухлокусных гаплотипов, образованных SNPs в точках -1031T/C, -863C/A промоторной области гена TNFA, расширенных гаплотипов TNFA HLA DRB1 проводился с использованием EM-алгоритма и оценки неравновесного сцепления (D’; χ2; р) с помощью программы Arlequin ver. 3.5. Сравнение двух выборок с целью поиска ассоциации с предрасположенностью к РА проводилось с использованием стандартных иммуногенетических критериев.
Значимость различий при p ≤ 0,05. Анализ данных показал, что двухлокусные гаплотипы -1031T/C и -863C/A TNFA не ассоциированы с предрасположенностью к ревматоидному артриту в популяции русских.
Установлены гаплотипы, ассоциированные с предрасположенностью к ревматоидному артриту: TNFA -863*a HLA DRB1*03, TNFA -1031*t HLA DRB1*04, TNFA -1031*t HLA DRB1*04. В исследовании выявлены следующие гаплотипы-протекторы: TNFA -1031*t HLA DRB1*15; TNFA -1031*t HLA DRB1*11.
Таким образом, наше исследование показывает, что кроме отдельных генных семейств HLA II класса в предрасположенность/устойчивость к ревматоидному артриту вносят вклад гаплотипические сочетания редких однонуклеотидных полиморфизмов в точках -1031, -863 С/А гена TNFA и HLA DRB1.

Об авторах

Д. С. Сташкевич

ФГБОУ ВО "Челябинский государственный университет"

Автор, ответственный за переписку.
Email: stashkevich_dary@mail.ru

 к.б.н., доцент, декан биологического факультета 

454021, Россия, г. Челябинск, ул. Молдавская, 25, кв. 15

Тел.: 8 (351) 799-71-54 

Россия

Е. Б. Хромова

ФГБОУ ВО "Челябинский государственный университет"

Email: eb_sh@mail.ru

 к.б.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета 

 Челябинск 

Россия

И. В. Девальд

ФГБОУ ВО "Челябинский государственный университет";
ФГБОУ ВО «Южно-Уральский государственный медицинский университет»

Email: inessa.devald@gmail.com

 к.м.н., доцент кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета; доцент кафедры терапии ИДПО  

 Челябинск 

Россия

Е. А. Ходус

Клиника профессора Кинзерского

Email: khoduslena@gmail.com

 к.м.н., врач-ревматолог  

 Челябинск 

А. Л. Бурмистрова

ФГБОУ ВО "Челябинский государственный университет"

Email: burmal@csu.ru

 д.м.н., профессор, заведующая кафедрой микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета 

 Челябинск 

Список литературы

  1. Кужир Т.Д. Полигенная природа ревматоидного артрита // Экологическая генетика, 2019. Т. 17, № 4. C. 77-90.
  2. Насонов Е.Л. Проблемы иммунопатологии ревматоидного артрита: эволюция болезни // Научно-практическая ревматология, 2017. Т. 55, № 3. С. 277-294.
  3. Сташкевич Д.С., Девальд И.В. Анализ двухлокусных гаплотипов HLA и TNFA у больных ревматоидным артритом башкирской популяции // Вестник Уральской медицинской академической науки, 2011. № 2-2 (35). С. 116-117.
  4. Суслова Т.А., Бурмистрова А.Л., Хромова Е.Б., Сташкевич Д.С., Девальд И.В., Исаканова А.О., Болдырева М.Н., Алексеев Л.П. Генетическая предрасположенность к ревматоидному артриту: роль генов и гаплотипов HLA класса II // Иммунология, 2008. Т. 29, № 3. С. 137-140.
  5. Excoffier L., Slatkin M. Maximum-likelihood estimation of molecular haplotype frequencies in a diploid population. Mol. Biol. Evol., 1995, Vol. 12, no. 5, pp. 921-927.
  6. Gabriel M.L., Braga F.B., Cardoso M.R., Lopes A.C., Piatto V.B., Souza A.S. The association between pro- and anti-inflammatory cytokine polymorphisms and periventricular leukomalacia in newborns with hypoxic-ischemic encephalopathy. J. Inflamm. Res., 2016, Vol. 9, pp. 59-67.
  7. Karami J., Aslani S., Jamshidi A., Garshasbi M., Mahmoudi M. Genetic implications in the pathogenesis of rheumatoid arthritis; an updated review. Gene, 2019, Vol. 702, pp. 8-16.
  8. Mikhaylenko D.S., Nemtsova M.V., Bure I.V. Genetic polymorphisms associated with rheumatoid arthritis development and antirheumatic therapy response. Int. J. Mol. Sci., 2020, Vol. 21, no. 14, 4911. doi: 10.3390/ijms21144911.
  9. Noack M., Miossec P. Selected cytokine pathways in rheumatoid arthritis. Semin. Immunopathol., 2017, Vol. 39, no. 4, pp. 365-383.
  10. Ridgley L.A., Anderson A.E., Pratt A.G. What are the dominant cytokines in early rheumatoid arthritis? Curr. Opin. Rheumatol., 2018, Vol. 30, no. 2, pp. 207-214.
  11. Sadaf T., John P., Bhatti A., Malik J.M. Lack of association of -863C/A (rs1800630) polymorphism of tumor necrosis factor-a gene with rheumatoid arthritis. Arch. Med. Sci., 2019, Vol. 15, no. 2, pp. 531-536.
  12. Sandoval-Pinto E., Padilla-Gutiérrez J.R., Valdés-Alvarado E., García-González I.J., Valdez-Haro A., Francisco Muñoz-Valle J., Flores-Salinas H. E., Brennan-Bourdon L.M., Valle Y. Association of the -1031T>C polymorphism and soluble TNF-α levels with Acute Coronary Syndrome. Cytokine, 2016, Vol. 78, pp. 37-43.
  13. Suslova T.A., Burmistrova A.L., Vavilov M.N., Chernova M.S., Khromova E.B., Belyaeva S.V., Zaripova O.N., Stashkevich D.S., Galkin A.S., Darke C. HLA gene and haplotype frequencies in a nagaybaks population from the Chelyabinsk region (Russian South Urals). Hum. Immunol., 2017, Vol. 78, no. 10, pp. 595-601.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Сташкевич Д.С., Хромова Е.Б., Девальд И.В., Ходус Е.А., Бурмистрова А.Л., 2021

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № 77 - 11525 от 04.01.2002.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах