АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ЭНХАНСЕРНОЙ РНК LINC00910, КОРРЕЛИРУЮЩЕЙ С ИММУНОРЕГУЛЯТОРОМ STAT3, В КЛЕТКАХ ГЛИОБЛАСТОМЫ
- Авторы: Стасевич Е.М.1,2, Симонова А.В.3, Уварова А.Н.1, Жеремян Э.А.1, Корнеев К.В.1, Богомолова Э.А.3, Демин Д.Э.1
-
Учреждения:
- Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия
- Московский физико-технический институт, 141700 Московская область, г. Долгопрудный, Россия
- Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии, 119991 Москва, Россия
- Раздел: Объединенный иммунологический форум 2024
- URL: https://rusimmun.ru/jour/article/view/16923
- DOI: https://doi.org/10.46235/1028-7221-16923-AOE
- ID: 16923
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Резюме
Фактор транскрипции STAT3 играет ключевую роль в передаче сигнала от рецепторов цитокинов и поэтому выполняет роль иммунорегулятора. В то же время, в различных типах раковых клеток STAT3 принимает участие в молекулярных механизмах онкогенеза. В частности, для глиобластомы была показана связь иммунорегулятора STAT3 с устойчивостью к наиболее распространенному для лечения этого типа рака химическому агенту темозоломиду. Кроме того, в литературе есть данные о том, активация данного онкогена в клетках глиобластомы способна играть ключевую роль в модуляции толерогенного микроокружения опухоли, ослабляя противоопухолевый иммунный ответ и способствуя агрессивному течению заболевания. Таким образом, подавление STAT3 может влиять не только на рост клеток и устойчивость к химиотерапии, но и также на микроокружение опухоли, усиливая иммунный ответ.
С развитием технологий секвенирования появились данные о том, что большая часть транскрибируемого материала в клетке является некодирующей. Все больше популярности набирает исследование длинных некодирующих РНК в онкогенезе, для которых была показана функциональная роль в развитии различных заболеваниях, в том числе в онкологии. В частности, особое внимание привлекает подтип длинных некодирующих РНК, транскрибируемый с энхансерных элементов, называемый энхансерные РНК, так как данный класс РНК обладает высокой специфичностью в различных клетках и тканях. Анализ коэкспрессии генов в опухолях глиобластомы выявил корреляцию экспрессии STAT3 с энхансерной РНК LINC00910, ген которой находится в одном хромосомном домене с геном STAT3. Ранее по литературным данным LINC00910 была ассоциирована с колоректальным раком и раком желудка. Данные базы GeneHancer также указывают на возможное участие энхансерной РНК LINC00910 в регуляции иммунорегулятора STAT3. Мы провели эффективный нокдаун энхансерной РНК LINC00910 с использованием метода РНК-интерференции, который привел к 8 - 10 кратному снижению его экспрессии в клеточных линиях глиобластомы. Снижение экспрессии LINC00910 не оказало значительного влияния на экспрессию гена STAT3 в клеточных линиях глиобластомы DBTRG-05MG и U251. Это указывает на то, что корреляция экспрессии РНК LINC00910 с экспрессией гена STAT3 не является следствием прямого участия LINC00910 в регуляции гена STAT3 в этих клетках. Дальнейшие исследования с использованием подобранной интерферирующей РНК позволят уточнить роль энхансерной РНК LINC00910 в других сигнальных путях, а также потенциальную связь данной энхансерной РНК с развитием рака.
Ключевые слова
Об авторах
Екатерина Михайловна Стасевич
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия;Московский физико-технический институт, 141700 Московская область, г. Долгопрудный, Россия
Автор, ответственный за переписку.
Email: ogstasevich@gmail.com
младший научный сотрудник
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНАнастасия Владимировна Симонова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии, 119991 Москва, Россия
Email: simonova_a_v@mail.ru
старший лаборант
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНАксинья Николаевна Уварова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия
Email: uvarowww@gmail.com
младший научный сотрудник
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНЭлина Алексеевна Жеремян
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия
Email: elyazheremyan@mail.ru
старший лаборант
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНКирилл Викторович Корнеев
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия
Email: kirkorneev@yandex.ru
к.б.н., научный сотрудник
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНЭльвина Андреевна Богомолова
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии, 119991 Москва, Россия
Email: elvina.elochka@gmail.com
старший лаборант
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНДенис Эриксонович Демин
Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия
Email: denisdeminbio@gmail.com
к.б.н., младший научный сотрудник
Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАНСписок литературы
- Chang N. et al. The role of STAT3 in glioblastoma progression through dual influences on tumor cells and the immune microenvironment. Molecular and cellular endocrinology, 2017, Т. 451, С. 53-65.
- Cruz J. V. R. et al. Obstacles to glioblastoma treatment two decades after temozolomide. Cancers, 2022, Т. 14, №. 13, С. 3203.
- Demin D. E. et al. Adversary of DNA integrity: A long non‐coding RNA stimulates driver oncogenic chromosomal rearrangement in human thyroid cells. International Journal of Cancer, 2023, Т. 152, №. 7, С. 1452-1462.
- Lee E. S. et al. Inhibition of STAT3 reverses drug resistance acquired in temozolomide-resistant human glioma cells. Oncology letters, 2011, Т. 2, №. 1, С. 115-121.
- Li Z. et al. Novel PBMC LncRNA signatures as diagnostic biomarkers for colorectal cancer. Pathology-Research and Practice, 2024, Т. 253, С. 154985.
- Lv Z. et al. Joint analysis of lncRNA m 6 A methylome and lncRNA/mRNA expression profiles in gastric cancer. Cancer cell international, 2020, Т. 20, С. 1-14.
- Kohsaka S. et al. STAT3 inhibition overcomes temozolomide resistance in glioblastoma by downregulating MGMT expression. Molecular cancer therapeutics, 2012, Т. 11, №. 6, С. 1289-1299.
- Piperi C., Papavassiliou K. A., Papavassiliou A. G. Pivotal role of STAT3 in shaping glioblastoma immune microenvironment. Cells, 2019, Т. 8, №. 11, С. 1398.
- Quinn J. J., Chang H. Y. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function. Nature reviews genetics, 2016, Т. 17, №. 1, С. 47-62.
- Stasevich E. M. et al. Enhancer RNA AL928768. 3 from the IGH locus regulates MYC expression and controls the proliferation and chemoresistance of Burkitt lymphoma cells with IGH/MYC translocation. International Journal of Molecular Sciences, 2022, Т. 23, №. 9, С. 4624.
- Stasevich E. M. et al. The role of non-coding RNAs in the regulation of the proto-oncogene MYC in different types of cancer. Biomedicines, 2021, Т. 9, №. 8, С. 921.
- Wu H. et al. Tissue-specific RNA expression marks distant-acting developmental enhancers. PLoS genetics, 2014, Т. 10, №. 9, С. e1004610.
- Yao Y. et al. B7-H4 (B7x)–Mediated Cross-talk between glioma-initiating cells and macrophages via the IL6/JAK/STAT3 pathway lead to poor prognosis in glioma patients. Clinical Cancer Research, 2016, Т. 22, №. 11, С. 2778-2790.