АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ЭНХАНСЕРНОЙ РНК LINC00910, КОРРЕЛИРУЮЩЕЙ С ИММУНОРЕГУЛЯТОРОМ STAT3, В КЛЕТКАХ ГЛИОБЛАСТОМЫ



Цитировать

Полный текст

Аннотация

Резюме

Фактор транскрипции STAT3 играет ключевую роль в передаче сигнала от рецепторов цитокинов и поэтому выполняет роль иммунорегулятора. В то же время, в различных типах раковых клеток STAT3 принимает участие в молекулярных механизмах онкогенеза. В частности, для глиобластомы была показана связь иммунорегулятора STAT3 с устойчивостью к наиболее распространенному для лечения этого типа рака химическому агенту темозоломиду. Кроме того, в литературе есть данные о том, активация данного онкогена в клетках глиобластомы способна играть ключевую роль в модуляции толерогенного микроокружения опухоли, ослабляя противоопухолевый иммунный ответ и способствуя агрессивному течению заболевания. Таким образом, подавление STAT3 может влиять не только на рост клеток и устойчивость к химиотерапии, но и также на микроокружение опухоли, усиливая иммунный ответ.

С развитием технологий секвенирования появились данные о том, что большая часть транскрибируемого материала в клетке является некодирующей. Все больше популярности набирает исследование длинных некодирующих РНК в онкогенезе, для которых была показана функциональная роль в развитии различных заболеваниях, в том числе в онкологии. В частности, особое внимание привлекает подтип длинных некодирующих РНК, транскрибируемый с энхансерных элементов, называемый энхансерные РНК, так как данный класс РНК обладает высокой специфичностью в различных клетках и тканях. Анализ коэкспрессии генов в опухолях глиобластомы выявил корреляцию экспрессии STAT3 с энхансерной РНК LINC00910, ген которой находится в одном хромосомном домене с геном STAT3. Ранее по литературным данным LINC00910 была ассоциирована с колоректальным раком и раком желудка. Данные базы GeneHancer также указывают на возможное участие энхансерной РНК LINC00910 в регуляции иммунорегулятора STAT3. Мы провели эффективный нокдаун энхансерной РНК LINC00910 с использованием метода РНК-интерференции, который привел к 8 - 10 кратному снижению его экспрессии в клеточных линиях глиобластомы. Снижение экспрессии LINC00910 не оказало значительного влияния на экспрессию гена STAT3 в клеточных линиях глиобластомы DBTRG-05MG и U251. Это указывает на то, что корреляция экспрессии РНК LINC00910 с экспрессией гена STAT3 не является следствием прямого участия LINC00910 в регуляции гена STAT3 в этих клетках. Дальнейшие исследования с использованием подобранной интерферирующей РНК позволят уточнить роль энхансерной РНК LINC00910 в других сигнальных путях, а также потенциальную связь данной энхансерной РНК с развитием рака.

Об авторах

Екатерина Михайловна Стасевич

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия;
Московский физико-технический институт, 141700 Московская область, г. Долгопрудный, Россия

Автор, ответственный за переписку.
Email: ogstasevich@gmail.com

младший научный сотрудник 

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Анастасия Владимировна Симонова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии, 119991 Москва, Россия

Email: simonova_a_v@mail.ru

старший лаборант 

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Аксинья Николаевна Уварова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия

Email: uvarowww@gmail.com

младший научный сотрудник 

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Элина Алексеевна Жеремян

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия

Email: elyazheremyan@mail.ru

старший лаборант 

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Кирилл Викторович Корнеев

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия

Email: kirkorneev@yandex.ru

к.б.н., научный сотрудник

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Эльвина Андреевна Богомолова

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Лаборатория передачи внутриклеточных сигналов в норме и патологии, 119991 Москва, Россия

Email: elvina.elochka@gmail.com

старший лаборант

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Денис Эриксонович Демин

Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН, Центр высокоточного редактирования и генетических технологий для биомедицины, 119991 Москва, Россия

Email: denisdeminbio@gmail.com

к.б.н., младший научный сотрудник 

Россия, 119991, г. Москва, ул. Вавилова, д. 32. ИМБ РАН

Список литературы

  1. Chang N. et al. The role of STAT3 in glioblastoma progression through dual influences on tumor cells and the immune microenvironment. Molecular and cellular endocrinology, 2017, Т. 451, С. 53-65.
  2. Cruz J. V. R. et al. Obstacles to glioblastoma treatment two decades after temozolomide. Cancers, 2022, Т. 14, №. 13, С. 3203.
  3. Demin D. E. et al. Adversary of DNA integrity: A long non‐coding RNA stimulates driver oncogenic chromosomal rearrangement in human thyroid cells. International Journal of Cancer, 2023, Т. 152, №. 7, С. 1452-1462.
  4. Lee E. S. et al. Inhibition of STAT3 reverses drug resistance acquired in temozolomide-resistant human glioma cells. Oncology letters, 2011, Т. 2, №. 1, С. 115-121.
  5. Li Z. et al. Novel PBMC LncRNA signatures as diagnostic biomarkers for colorectal cancer. Pathology-Research and Practice, 2024, Т. 253, С. 154985.
  6. Lv Z. et al. Joint analysis of lncRNA m 6 A methylome and lncRNA/mRNA expression profiles in gastric cancer. Cancer cell international, 2020, Т. 20, С. 1-14.
  7. Kohsaka S. et al. STAT3 inhibition overcomes temozolomide resistance in glioblastoma by downregulating MGMT expression. Molecular cancer therapeutics, 2012, Т. 11, №. 6, С. 1289-1299.
  8. Piperi C., Papavassiliou K. A., Papavassiliou A. G. Pivotal role of STAT3 in shaping glioblastoma immune microenvironment. Cells, 2019, Т. 8, №. 11, С. 1398.
  9. Quinn J. J., Chang H. Y. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function. Nature reviews genetics, 2016, Т. 17, №. 1, С. 47-62.
  10. Stasevich E. M. et al. Enhancer RNA AL928768. 3 from the IGH locus regulates MYC expression and controls the proliferation and chemoresistance of Burkitt lymphoma cells with IGH/MYC translocation. International Journal of Molecular Sciences, 2022, Т. 23, №. 9, С. 4624.
  11. Stasevich E. M. et al. The role of non-coding RNAs in the regulation of the proto-oncogene MYC in different types of cancer. Biomedicines, 2021, Т. 9, №. 8, С. 921.
  12. Wu H. et al. Tissue-specific RNA expression marks distant-acting developmental enhancers. PLoS genetics, 2014, Т. 10, №. 9, С. e1004610.
  13. Yao Y. et al. B7-H4 (B7x)–Mediated Cross-talk between glioma-initiating cells and macrophages via the IL6/JAK/STAT3 pathway lead to poor prognosis in glioma patients. Clinical Cancer Research, 2016, Т. 22, №. 11, С. 2778-2790.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Стасевич Е.М., Симонова А.В., Уварова А.Н., Жеремян Э.А., Корнеев К.В., Богомолова Э.А., Демин Д.Э.,

Creative Commons License
Эта статья доступна по лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License.

СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: серия ПИ № 77 - 11525 от 04.01.2002.


Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах